胡波教授團隊發(fā)表肝癌預后評估重要學術成果

? ? 近日，我院檢驗科主任胡波教授團隊與感染性疾病科崇雨田教授團隊、生物治療中心張琪教授團隊在數(shù)學與計算生物學領域高水平雜志Briefings in Bioinformatics?（2021 IF: 8.9）發(fā)表了題目為“HCC subtypes based on the activity changes of immunologic and hallmark gene sets in tumor and nontumor tissues”的原創(chuàng)性成果。龔嬌、李榮為論文的共同第一作者，胡波、崇雨田、張琪教授為論文的共同通訊作者。

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? ? 肝細胞肝癌（hepatocellular carcinoma, HCC）是嚴重威脅人類健康的惡性腫瘤，其發(fā)病率在各類腫瘤中居于第五，死亡率居于第三。我國是HCC的高發(fā)區(qū)，每年約有40萬新增病例，約占全球總新發(fā)病例的 40%。近年來，胡波教授團隊一直從事肝臟疾病相關研究，致力于篩選出新的檢驗指標，更好地輔助疾病的診斷及預后的評估，為臨床提供支持。目前，HCC患者的預后評估主要基于腫瘤本身的性狀，而癌旁組織在預后中的作用尚不明確。

本研究首次發(fā)現(xiàn)，HCC和癌旁組織中免疫和標志基因集的活性變化可以用于HCC患者的分型，且不同分型與患者的預后密切相關。亞型1的患者預后顯著好于亞型2和亞型3。研究還進一步篩選并驗證了與預后緊密相關的3個腫瘤基因集、4個癌旁基因集。功能富集分析發(fā)現(xiàn)，4個癌旁基因集中的基因與免疫反應、細胞粘附等信號通路密切相關，可能影響轉移和復發(fā)，提示免疫治療時應考慮癌旁組織的性狀；而3個腫瘤基因集中的基因則與細胞周期等通路密切相關，這與之前的研究一致?？偟膩碚f，本研究首次在HCC領域綜合癌旁和癌組織的基因集的富集分數(shù)，對患者進行分型及預后評估，為HCC的治療提供了新的思路——在選擇HCC治療方式時，應該綜合考慮癌旁及癌組織的變化。

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3個HCC亞型的代表性的免疫和標志基因集的熱圖

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參考文獻:

Gong J, Li R, Chen Y, Zhuo Z, Chen S, Cao J, Zhang Q, Chong Y, Hu B. HCC subtypes based on the activity changes of immunologic and hallmark gene sets in tumor and nontumor tissues.?Brief Bioinform. 2021 Jan 30:bbaa427. doi: 10.1093/bib/bbaa427. Epub ahead of print. PMID: 33515024.

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